Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms