Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccbe1Q3MI99 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccbe1Q3MI99 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccbe1Q3MI99 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccbe1Q3MI99 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccbe1Q3MI99 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccbe1Q3MI99 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccbe1Q3MI99 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccbe1Q3MI99 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccbe1Q3MI99 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccbe1Q3MI99 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccbe1Q3MI99 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccbe1Q3MI99 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccbe1Q3MI99 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccbe1Q3MI99 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccbe1Q3MI99 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccbe1Q3MI99 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccbe1Q3MI99 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccbe1Q3MI99 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccbe1Q3MI99 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccbe1Q3MI99 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccbe1Q3MI99 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccbe1Q3MI99 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccbe1Q3MI99 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccbe1Q3MI99 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccbe1Q3MI99 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccbe1Q3MI99 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccbe1Q3MI99 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccbe1Q3MI99 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccbe1Q3MI99 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccbe1Q3MI99 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccbe1Q3MI99 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccbe1Q3MI99 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccbe1Q3MI99 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccbe1Q3MI99 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccbe1Q3MI99 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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