Protein–RNA interactions for Protein: Q33DR2

Pdss1, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 1, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdss1Q33DR2 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pdss1Q33DR2 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pdss1Q33DR2 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pdss1Q33DR2 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pdss1Q33DR2 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pdss1Q33DR2 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pdss1Q33DR2 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pdss1Q33DR2 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pdss1Q33DR2 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pdss1Q33DR2 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pdss1Q33DR2 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pdss1Q33DR2 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pdss1Q33DR2 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pdss1Q33DR2 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pdss1Q33DR2 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Pdss1Q33DR2 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pdss1Q33DR2 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pdss1Q33DR2 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pdss1Q33DR2 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pdss1Q33DR2 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pdss1Q33DR2 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pdss1Q33DR2 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pdss1Q33DR2 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pdss1Q33DR2 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pdss1Q33DR2 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pdss1Q33DR2 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pdss1Q33DR2 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pdss1Q33DR2 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pdss1Q33DR2 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pdss1Q33DR2 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pdss1Q33DR2 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pdss1Q33DR2 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Pdss1Q33DR2 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pdss1Q33DR2 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pdss1Q33DR2 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pdss1Q33DR2 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pdss1Q33DR2 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pdss1Q33DR2 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pdss1Q33DR2 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pdss1Q33DR2 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pdss1Q33DR2 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Pdss1Q33DR2 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pdss1Q33DR2 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pdss1Q33DR2 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Pdss1Q33DR2 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pdss1Q33DR2 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pdss1Q33DR2 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pdss1Q33DR2 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pdss1Q33DR2 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pdss1Q33DR2 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pdss1Q33DR2 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pdss1Q33DR2 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pdss1Q33DR2 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pdss1Q33DR2 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pdss1Q33DR2 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pdss1Q33DR2 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pdss1Q33DR2 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pdss1Q33DR2 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pdss1Q33DR2 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pdss1Q33DR2 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pdss1Q33DR2 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pdss1Q33DR2 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pdss1Q33DR2 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pdss1Q33DR2 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Pdss1Q33DR2 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pdss1Q33DR2 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Pdss1Q33DR2 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pdss1Q33DR2 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Pdss1Q33DR2 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pdss1Q33DR2 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pdss1Q33DR2 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pdss1Q33DR2 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pdss1Q33DR2 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pdss1Q33DR2 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pdss1Q33DR2 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pdss1Q33DR2 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pdss1Q33DR2 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pdss1Q33DR2 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pdss1Q33DR2 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pdss1Q33DR2 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pdss1Q33DR2 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Pdss1Q33DR2 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pdss1Q33DR2 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pdss1Q33DR2 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pdss1Q33DR2 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pdss1Q33DR2 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pdss1Q33DR2 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pdss1Q33DR2 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pdss1Q33DR2 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pdss1Q33DR2 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pdss1Q33DR2 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pdss1Q33DR2 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pdss1Q33DR2 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pdss1Q33DR2 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pdss1Q33DR2 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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