Protein–RNA interactions for Protein: Q2V6D6

Gbp8, Guanylate-binding protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp8Q2V6D6 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp8Q2V6D6 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gbp8Q2V6D6 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp8Q2V6D6 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp8Q2V6D6 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp8Q2V6D6 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp8Q2V6D6 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp8Q2V6D6 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp8Q2V6D6 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp8Q2V6D6 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp8Q2V6D6 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp8Q2V6D6 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp8Q2V6D6 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp8Q2V6D6 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gbp8Q2V6D6 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp8Q2V6D6 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp8Q2V6D6 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp8Q2V6D6 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp8Q2V6D6 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gbp8Q2V6D6 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp8Q2V6D6 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp8Q2V6D6 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp8Q2V6D6 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp8Q2V6D6 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp8Q2V6D6 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp8Q2V6D6 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp8Q2V6D6 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp8Q2V6D6 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp8Q2V6D6 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp8Q2V6D6 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp8Q2V6D6 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp8Q2V6D6 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp8Q2V6D6 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gbp8Q2V6D6 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp8Q2V6D6 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp8Q2V6D6 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp8Q2V6D6 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp8Q2V6D6 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp8Q2V6D6 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp8Q2V6D6 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp8Q2V6D6 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp8Q2V6D6 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp8Q2V6D6 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp8Q2V6D6 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp8Q2V6D6 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp8Q2V6D6 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp8Q2V6D6 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp8Q2V6D6 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gbp8Q2V6D6 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gbp8Q2V6D6 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp8Q2V6D6 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp8Q2V6D6 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp8Q2V6D6 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp8Q2V6D6 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp8Q2V6D6 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp8Q2V6D6 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp8Q2V6D6 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp8Q2V6D6 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp8Q2V6D6 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp8Q2V6D6 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp8Q2V6D6 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp8Q2V6D6 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp8Q2V6D6 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp8Q2V6D6 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp8Q2V6D6 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp8Q2V6D6 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp8Q2V6D6 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp8Q2V6D6 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp8Q2V6D6 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp8Q2V6D6 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp8Q2V6D6 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gbp8Q2V6D6 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gbp8Q2V6D6 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gbp8Q2V6D6 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gbp8Q2V6D6 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Gbp8Q2V6D6 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gbp8Q2V6D6 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gbp8Q2V6D6 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Gbp8Q2V6D6 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbp8Q2V6D6 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Gbp8Q2V6D6 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbp8Q2V6D6 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbp8Q2V6D6 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbp8Q2V6D6 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbp8Q2V6D6 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbp8Q2V6D6 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbp8Q2V6D6 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbp8Q2V6D6 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbp8Q2V6D6 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbp8Q2V6D6 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbp8Q2V6D6 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gbp8Q2V6D6 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gbp8Q2V6D6 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbp8Q2V6D6 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbp8Q2V6D6 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gbp8Q2V6D6 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gbp8Q2V6D6 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbp8Q2V6D6 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbp8Q2V6D6 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gbp8Q2V6D6 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms