Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Shroom4Q1W617 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Shroom4Q1W617 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Shroom4Q1W617 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
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Shroom4Q1W617 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Shroom4Q1W617 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Shroom4Q1W617 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Shroom4Q1W617 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Shroom4Q1W617 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Shroom4Q1W617 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Shroom4Q1W617 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Shroom4Q1W617 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
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Shroom4Q1W617 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Shroom4Q1W617 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
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Shroom4Q1W617 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
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Shroom4Q1W617 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Shroom4Q1W617 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
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Shroom4Q1W617 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Shroom4Q1W617 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Shroom4Q1W617 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Shroom4Q1W617 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Shroom4Q1W617 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
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Shroom4Q1W617 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Shroom4Q1W617 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Shroom4Q1W617 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
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Shroom4Q1W617 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
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Shroom4Q1W617 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
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Shroom4Q1W617 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Shroom4Q1W617 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
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Shroom4Q1W617 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
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Shroom4Q1W617 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Shroom4Q1W617 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Shroom4Q1W617 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Shroom4Q1W617 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Shroom4Q1W617 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Shroom4Q1W617 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Shroom4Q1W617 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Shroom4Q1W617 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Shroom4Q1W617 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Shroom4Q1W617 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Shroom4Q1W617 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
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Shroom4Q1W617 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
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