Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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