Protein–RNA interactions for Protein: Q1EG27

Myo3b, Myosin-IIIb, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo3bQ1EG27 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Myo3bQ1EG27 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Myo3bQ1EG27 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Myo3bQ1EG27 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Myo3bQ1EG27 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Myo3bQ1EG27 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Myo3bQ1EG27 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Myo3bQ1EG27 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Myo3bQ1EG27 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Myo3bQ1EG27 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Myo3bQ1EG27 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Myo3bQ1EG27 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Myo3bQ1EG27 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Myo3bQ1EG27 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Myo3bQ1EG27 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Myo3bQ1EG27 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Myo3bQ1EG27 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Myo3bQ1EG27 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Myo3bQ1EG27 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Myo3bQ1EG27 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Myo3bQ1EG27 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Myo3bQ1EG27 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Myo3bQ1EG27 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Myo3bQ1EG27 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Myo3bQ1EG27 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Myo3bQ1EG27 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Myo3bQ1EG27 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Myo3bQ1EG27 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Myo3bQ1EG27 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Myo3bQ1EG27 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Myo3bQ1EG27 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Myo3bQ1EG27 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Myo3bQ1EG27 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Myo3bQ1EG27 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Myo3bQ1EG27 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Myo3bQ1EG27 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Myo3bQ1EG27 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Myo3bQ1EG27 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Myo3bQ1EG27 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Myo3bQ1EG27 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Myo3bQ1EG27 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Myo3bQ1EG27 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Myo3bQ1EG27 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Myo3bQ1EG27 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Myo3bQ1EG27 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Myo3bQ1EG27 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Myo3bQ1EG27 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Myo3bQ1EG27 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Myo3bQ1EG27 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Myo3bQ1EG27 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Myo3bQ1EG27 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Myo3bQ1EG27 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Myo3bQ1EG27 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Myo3bQ1EG27 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Myo3bQ1EG27 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Myo3bQ1EG27 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Myo3bQ1EG27 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Myo3bQ1EG27 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Myo3bQ1EG27 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Myo3bQ1EG27 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Myo3bQ1EG27 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Myo3bQ1EG27 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Myo3bQ1EG27 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Myo3bQ1EG27 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Myo3bQ1EG27 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Myo3bQ1EG27 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Myo3bQ1EG27 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Myo3bQ1EG27 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Myo3bQ1EG27 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Myo3bQ1EG27 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Myo3bQ1EG27 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Myo3bQ1EG27 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Myo3bQ1EG27 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Myo3bQ1EG27 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Myo3bQ1EG27 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Myo3bQ1EG27 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Myo3bQ1EG27 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Myo3bQ1EG27 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Myo3bQ1EG27 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Myo3bQ1EG27 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Myo3bQ1EG27 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Myo3bQ1EG27 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Myo3bQ1EG27 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Myo3bQ1EG27 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Myo3bQ1EG27 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Myo3bQ1EG27 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Myo3bQ1EG27 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Myo3bQ1EG27 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Myo3bQ1EG27 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Myo3bQ1EG27 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Myo3bQ1EG27 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Myo3bQ1EG27 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Myo3bQ1EG27 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Myo3bQ1EG27 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Myo3bQ1EG27 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Myo3bQ1EG27 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Myo3bQ1EG27 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Myo3bQ1EG27 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Myo3bQ1EG27 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Myo3bQ1EG27 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms