Protein–RNA interactions for Protein: Q14DL3

Lrriq3, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrriq3Q14DL3 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrriq3Q14DL3 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrriq3Q14DL3 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrriq3Q14DL3 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrriq3Q14DL3 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrriq3Q14DL3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrriq3Q14DL3 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrriq3Q14DL3 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrriq3Q14DL3 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrriq3Q14DL3 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrriq3Q14DL3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrriq3Q14DL3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrriq3Q14DL3 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrriq3Q14DL3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrriq3Q14DL3 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrriq3Q14DL3 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrriq3Q14DL3 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrriq3Q14DL3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrriq3Q14DL3 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrriq3Q14DL3 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrriq3Q14DL3 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrriq3Q14DL3 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrriq3Q14DL3 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrriq3Q14DL3 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrriq3Q14DL3 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrriq3Q14DL3 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrriq3Q14DL3 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrriq3Q14DL3 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrriq3Q14DL3 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrriq3Q14DL3 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrriq3Q14DL3 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrriq3Q14DL3 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrriq3Q14DL3 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrriq3Q14DL3 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrriq3Q14DL3 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrriq3Q14DL3 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrriq3Q14DL3 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrriq3Q14DL3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrriq3Q14DL3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrriq3Q14DL3 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrriq3Q14DL3 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrriq3Q14DL3 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrriq3Q14DL3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrriq3Q14DL3 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrriq3Q14DL3 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrriq3Q14DL3 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrriq3Q14DL3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrriq3Q14DL3 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrriq3Q14DL3 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrriq3Q14DL3 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrriq3Q14DL3 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrriq3Q14DL3 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrriq3Q14DL3 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrriq3Q14DL3 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrriq3Q14DL3 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrriq3Q14DL3 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrriq3Q14DL3 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrriq3Q14DL3 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrriq3Q14DL3 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrriq3Q14DL3 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrriq3Q14DL3 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrriq3Q14DL3 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrriq3Q14DL3 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrriq3Q14DL3 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrriq3Q14DL3 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrriq3Q14DL3 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrriq3Q14DL3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrriq3Q14DL3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrriq3Q14DL3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrriq3Q14DL3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrriq3Q14DL3 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrriq3Q14DL3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrriq3Q14DL3 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrriq3Q14DL3 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrriq3Q14DL3 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrriq3Q14DL3 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrriq3Q14DL3 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrriq3Q14DL3 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrriq3Q14DL3 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrriq3Q14DL3 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrriq3Q14DL3 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrriq3Q14DL3 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrriq3Q14DL3 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrriq3Q14DL3 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrriq3Q14DL3 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrriq3Q14DL3 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrriq3Q14DL3 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrriq3Q14DL3 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrriq3Q14DL3 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrriq3Q14DL3 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrriq3Q14DL3 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrriq3Q14DL3 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrriq3Q14DL3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrriq3Q14DL3 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrriq3Q14DL3 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrriq3Q14DL3 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrriq3Q14DL3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrriq3Q14DL3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrriq3Q14DL3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrriq3Q14DL3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms