Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms