Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE29

Samd12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd12Q0VE29 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samd12Q0VE29 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samd12Q0VE29 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samd12Q0VE29 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samd12Q0VE29 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samd12Q0VE29 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samd12Q0VE29 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samd12Q0VE29 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samd12Q0VE29 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samd12Q0VE29 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samd12Q0VE29 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samd12Q0VE29 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samd12Q0VE29 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samd12Q0VE29 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samd12Q0VE29 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samd12Q0VE29 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samd12Q0VE29 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samd12Q0VE29 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samd12Q0VE29 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samd12Q0VE29 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samd12Q0VE29 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samd12Q0VE29 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samd12Q0VE29 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Samd12Q0VE29 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Samd12Q0VE29 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Samd12Q0VE29 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Samd12Q0VE29 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Samd12Q0VE29 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Samd12Q0VE29 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Samd12Q0VE29 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Samd12Q0VE29 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Samd12Q0VE29 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Samd12Q0VE29 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Samd12Q0VE29 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Samd12Q0VE29 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Samd12Q0VE29 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Samd12Q0VE29 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Samd12Q0VE29 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Samd12Q0VE29 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Samd12Q0VE29 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Samd12Q0VE29 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Samd12Q0VE29 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Samd12Q0VE29 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Samd12Q0VE29 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Samd12Q0VE29 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Samd12Q0VE29 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Samd12Q0VE29 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Samd12Q0VE29 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Samd12Q0VE29 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Samd12Q0VE29 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Samd12Q0VE29 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Samd12Q0VE29 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Samd12Q0VE29 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Samd12Q0VE29 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Samd12Q0VE29 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Samd12Q0VE29 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Samd12Q0VE29 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Samd12Q0VE29 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Samd12Q0VE29 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Samd12Q0VE29 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Samd12Q0VE29 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Samd12Q0VE29 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Samd12Q0VE29 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Samd12Q0VE29 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Samd12Q0VE29 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Samd12Q0VE29 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Samd12Q0VE29 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Samd12Q0VE29 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Samd12Q0VE29 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Samd12Q0VE29 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Samd12Q0VE29 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Samd12Q0VE29 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Samd12Q0VE29 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Samd12Q0VE29 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms