Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms