Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ttc21bQ0HA38 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ttc21bQ0HA38 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ttc21bQ0HA38 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ttc21bQ0HA38 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ttc21bQ0HA38 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ttc21bQ0HA38 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ttc21bQ0HA38 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ttc21bQ0HA38 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ttc21bQ0HA38 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Ttc21bQ0HA38 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ttc21bQ0HA38 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ttc21bQ0HA38 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ttc21bQ0HA38 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ttc21bQ0HA38 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ttc21bQ0HA38 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ttc21bQ0HA38 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Ttc21bQ0HA38 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ttc21bQ0HA38 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ttc21bQ0HA38 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ttc21bQ0HA38 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ttc21bQ0HA38 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Ttc21bQ0HA38 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ttc21bQ0HA38 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ttc21bQ0HA38 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ttc21bQ0HA38 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ttc21bQ0HA38 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ttc21bQ0HA38 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ttc21bQ0HA38 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ttc21bQ0HA38 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ttc21bQ0HA38 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ttc21bQ0HA38 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ttc21bQ0HA38 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Ttc21bQ0HA38 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ttc21bQ0HA38 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ttc21bQ0HA38 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ttc21bQ0HA38 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ttc21bQ0HA38 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ttc21bQ0HA38 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ttc21bQ0HA38 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ttc21bQ0HA38 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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Ttc21bQ0HA38 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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Ttc21bQ0HA38 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Ttc21bQ0HA38 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ttc21bQ0HA38 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ttc21bQ0HA38 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ttc21bQ0HA38 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ttc21bQ0HA38 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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Ttc21bQ0HA38 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ttc21bQ0HA38 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ttc21bQ0HA38 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ttc21bQ0HA38 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ttc21bQ0HA38 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ttc21bQ0HA38 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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Ttc21bQ0HA38 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ttc21bQ0HA38 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ttc21bQ0HA38 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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Ttc21bQ0HA38 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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Ttc21bQ0HA38 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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Ttc21bQ0HA38 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ttc21bQ0HA38 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ttc21bQ0HA38 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ttc21bQ0HA38 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ttc21bQ0HA38 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ttc21bQ0HA38 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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Ttc21bQ0HA38 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttc21bQ0HA38 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttc21bQ0HA38 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
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Ttc21bQ0HA38 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttc21bQ0HA38 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttc21bQ0HA38 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttc21bQ0HA38 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttc21bQ0HA38 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttc21bQ0HA38 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttc21bQ0HA38 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttc21bQ0HA38 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttc21bQ0HA38 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttc21bQ0HA38 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttc21bQ0HA38 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttc21bQ0HA38 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttc21bQ0HA38 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ttc21bQ0HA38 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ttc21bQ0HA38 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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