Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf541Q0GGX2 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms