Protein–RNA interactions for Protein: Q08943

Ssrp1, FACT complex subunit SSRP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssrp1Q08943 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms