Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgm3Q08189 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgm3Q08189 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgm3Q08189 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgm3Q08189 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgm3Q08189 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgm3Q08189 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgm3Q08189 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgm3Q08189 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgm3Q08189 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgm3Q08189 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgm3Q08189 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgm3Q08189 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgm3Q08189 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgm3Q08189 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgm3Q08189 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgm3Q08189 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgm3Q08189 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms