Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
MestQ07646 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MestQ07646 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MestQ07646 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MestQ07646 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MestQ07646 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
MestQ07646 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MestQ07646 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MestQ07646 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MestQ07646 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
MestQ07646 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
MestQ07646 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
MestQ07646 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
MestQ07646 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
MestQ07646 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
MestQ07646 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
MestQ07646 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
MestQ07646 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
MestQ07646 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
MestQ07646 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
MestQ07646 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
MestQ07646 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
MestQ07646 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
MestQ07646 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
MestQ07646 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
MestQ07646 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
MestQ07646 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
MestQ07646 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
MestQ07646 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
MestQ07646 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
MestQ07646 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
MestQ07646 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
MestQ07646 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
MestQ07646 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
MestQ07646 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
MestQ07646 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
MestQ07646 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
MestQ07646 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
MestQ07646 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
MestQ07646 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
MestQ07646 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
MestQ07646 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
MestQ07646 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
MestQ07646 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
MestQ07646 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
MestQ07646 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
MestQ07646 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
MestQ07646 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
MestQ07646 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
MestQ07646 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
MestQ07646 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
MestQ07646 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
MestQ07646 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
MestQ07646 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
MestQ07646 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
MestQ07646 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
MestQ07646 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
MestQ07646 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
MestQ07646 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
MestQ07646 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
MestQ07646 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
MestQ07646 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
MestQ07646 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
MestQ07646 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
MestQ07646 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
MestQ07646 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
MestQ07646 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
MestQ07646 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
MestQ07646 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
MestQ07646 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
MestQ07646 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
MestQ07646 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
MestQ07646 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
MestQ07646 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
MestQ07646 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
MestQ07646 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
MestQ07646 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
MestQ07646 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MestQ07646 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MestQ07646 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
MestQ07646 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MestQ07646 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MestQ07646 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
MestQ07646 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MestQ07646 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
MestQ07646 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
MestQ07646 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MestQ07646 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
MestQ07646 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MestQ07646 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MestQ07646 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
MestQ07646 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MestQ07646 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
MestQ07646 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
MestQ07646 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
MestQ07646 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
MestQ07646 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
MestQ07646 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MestQ07646 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MestQ07646 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms