Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
AmbpQ07456 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
AmbpQ07456 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
AmbpQ07456 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
AmbpQ07456 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
AmbpQ07456 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
AmbpQ07456 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
AmbpQ07456 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
AmbpQ07456 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
AmbpQ07456 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
AmbpQ07456 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
AmbpQ07456 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
AmbpQ07456 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
AmbpQ07456 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
AmbpQ07456 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
AmbpQ07456 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
AmbpQ07456 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
AmbpQ07456 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
AmbpQ07456 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
AmbpQ07456 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
AmbpQ07456 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
AmbpQ07456 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
AmbpQ07456 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
AmbpQ07456 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
AmbpQ07456 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
AmbpQ07456 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
AmbpQ07456 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
AmbpQ07456 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
AmbpQ07456 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
AmbpQ07456 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
AmbpQ07456 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
AmbpQ07456 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
AmbpQ07456 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
AmbpQ07456 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
AmbpQ07456 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
AmbpQ07456 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
AmbpQ07456 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
AmbpQ07456 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
AmbpQ07456 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
AmbpQ07456 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
AmbpQ07456 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
AmbpQ07456 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
AmbpQ07456 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
AmbpQ07456 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
AmbpQ07456 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
AmbpQ07456 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
AmbpQ07456 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
AmbpQ07456 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
AmbpQ07456 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
AmbpQ07456 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
AmbpQ07456 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
AmbpQ07456 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
AmbpQ07456 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.36
AmbpQ07456 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
AmbpQ07456 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
AmbpQ07456 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
AmbpQ07456 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
AmbpQ07456 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
AmbpQ07456 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms