Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms