Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms