Protein–RNA interactions for Protein: Q05AH6

SPINDOC, SPIN1-docking protein, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINDOCQ05AH6 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPINDOCQ05AH6 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SPINDOCQ05AH6 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SPINDOCQ05AH6 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPINDOCQ05AH6 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SPINDOCQ05AH6 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPINDOCQ05AH6 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SPINDOCQ05AH6 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SPINDOCQ05AH6 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPINDOCQ05AH6 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SPINDOCQ05AH6 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPINDOCQ05AH6 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPINDOCQ05AH6 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPINDOCQ05AH6 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPINDOCQ05AH6 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPINDOCQ05AH6 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPINDOCQ05AH6 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPINDOCQ05AH6 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPINDOCQ05AH6 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPINDOCQ05AH6 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPINDOCQ05AH6 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPINDOCQ05AH6 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPINDOCQ05AH6 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPINDOCQ05AH6 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPINDOCQ05AH6 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPINDOCQ05AH6 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPINDOCQ05AH6 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPINDOCQ05AH6 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPINDOCQ05AH6 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPINDOCQ05AH6 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPINDOCQ05AH6 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPINDOCQ05AH6 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPINDOCQ05AH6 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPINDOCQ05AH6 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPINDOCQ05AH6 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPINDOCQ05AH6 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPINDOCQ05AH6 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPINDOCQ05AH6 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPINDOCQ05AH6 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SPINDOCQ05AH6 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPINDOCQ05AH6 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPINDOCQ05AH6 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPINDOCQ05AH6 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPINDOCQ05AH6 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SPINDOCQ05AH6 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPINDOCQ05AH6 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPINDOCQ05AH6 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPINDOCQ05AH6 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPINDOCQ05AH6 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPINDOCQ05AH6 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPINDOCQ05AH6 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPINDOCQ05AH6 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPINDOCQ05AH6 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPINDOCQ05AH6 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPINDOCQ05AH6 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPINDOCQ05AH6 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPINDOCQ05AH6 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPINDOCQ05AH6 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPINDOCQ05AH6 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPINDOCQ05AH6 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPINDOCQ05AH6 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPINDOCQ05AH6 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPINDOCQ05AH6 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPINDOCQ05AH6 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPINDOCQ05AH6 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPINDOCQ05AH6 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SPINDOCQ05AH6 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPINDOCQ05AH6 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPINDOCQ05AH6 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPINDOCQ05AH6 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPINDOCQ05AH6 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPINDOCQ05AH6 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPINDOCQ05AH6 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPINDOCQ05AH6 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPINDOCQ05AH6 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPINDOCQ05AH6 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPINDOCQ05AH6 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPINDOCQ05AH6 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPINDOCQ05AH6 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPINDOCQ05AH6 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPINDOCQ05AH6 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPINDOCQ05AH6 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SPINDOCQ05AH6 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPINDOCQ05AH6 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPINDOCQ05AH6 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPINDOCQ05AH6 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPINDOCQ05AH6 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPINDOCQ05AH6 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPINDOCQ05AH6 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPINDOCQ05AH6 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPINDOCQ05AH6 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPINDOCQ05AH6 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPINDOCQ05AH6 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPINDOCQ05AH6 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPINDOCQ05AH6 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPINDOCQ05AH6 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SPINDOCQ05AH6 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPINDOCQ05AH6 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPINDOCQ05AH6 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPINDOCQ05AH6 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.9 ms