Protein–RNA interactions for Protein: Q05A13

Sdr16c6, Short-chain dehydrogenase/reductase family 16C member 6, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr16c6Q05A13 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sdr16c6Q05A13 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sdr16c6Q05A13 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sdr16c6Q05A13 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sdr16c6Q05A13 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sdr16c6Q05A13 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sdr16c6Q05A13 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sdr16c6Q05A13 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sdr16c6Q05A13 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sdr16c6Q05A13 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sdr16c6Q05A13 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sdr16c6Q05A13 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sdr16c6Q05A13 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sdr16c6Q05A13 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sdr16c6Q05A13 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sdr16c6Q05A13 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Sdr16c6Q05A13 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sdr16c6Q05A13 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sdr16c6Q05A13 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sdr16c6Q05A13 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sdr16c6Q05A13 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sdr16c6Q05A13 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sdr16c6Q05A13 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sdr16c6Q05A13 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms