Protein–RNA interactions for Protein: Q05860

Fmn1, Formin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmn1Q05860 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fmn1Q05860 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fmn1Q05860 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Fmn1Q05860 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fmn1Q05860 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fmn1Q05860 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fmn1Q05860 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fmn1Q05860 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fmn1Q05860 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fmn1Q05860 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fmn1Q05860 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fmn1Q05860 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fmn1Q05860 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fmn1Q05860 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Fmn1Q05860 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fmn1Q05860 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fmn1Q05860 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fmn1Q05860 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Fmn1Q05860 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fmn1Q05860 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fmn1Q05860 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fmn1Q05860 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fmn1Q05860 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fmn1Q05860 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fmn1Q05860 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fmn1Q05860 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fmn1Q05860 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fmn1Q05860 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fmn1Q05860 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fmn1Q05860 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fmn1Q05860 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fmn1Q05860 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fmn1Q05860 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fmn1Q05860 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fmn1Q05860 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fmn1Q05860 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Fmn1Q05860 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Fmn1Q05860 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fmn1Q05860 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fmn1Q05860 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fmn1Q05860 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fmn1Q05860 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fmn1Q05860 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Fmn1Q05860 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fmn1Q05860 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fmn1Q05860 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fmn1Q05860 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fmn1Q05860 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fmn1Q05860 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fmn1Q05860 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Fmn1Q05860 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fmn1Q05860 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fmn1Q05860 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fmn1Q05860 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fmn1Q05860 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fmn1Q05860 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fmn1Q05860 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fmn1Q05860 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fmn1Q05860 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fmn1Q05860 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fmn1Q05860 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fmn1Q05860 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Fmn1Q05860 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fmn1Q05860 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fmn1Q05860 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fmn1Q05860 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fmn1Q05860 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fmn1Q05860 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fmn1Q05860 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fmn1Q05860 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fmn1Q05860 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Fmn1Q05860 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fmn1Q05860 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Fmn1Q05860 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Fmn1Q05860 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fmn1Q05860 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fmn1Q05860 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fmn1Q05860 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fmn1Q05860 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fmn1Q05860 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fmn1Q05860 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fmn1Q05860 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fmn1Q05860 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Fmn1Q05860 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fmn1Q05860 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fmn1Q05860 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fmn1Q05860 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fmn1Q05860 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fmn1Q05860 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fmn1Q05860 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fmn1Q05860 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fmn1Q05860 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fmn1Q05860 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fmn1Q05860 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fmn1Q05860 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fmn1Q05860 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fmn1Q05860 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fmn1Q05860 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fmn1Q05860 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fmn1Q05860 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms