Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Top1Q04750 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Top1Q04750 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Top1Q04750 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Top1Q04750 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Top1Q04750 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Top1Q04750 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Top1Q04750 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Top1Q04750 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Top1Q04750 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Top1Q04750 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Top1Q04750 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Top1Q04750 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms