Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 5930422O12Rik-201ENSMUST00000059351 840 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Bud31-203ENSMUST00000160075 928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Gm5797-201ENSMUST00000100886 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Smgc-203ENSMUST00000109276 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Gm3149-201ENSMUST00000112779 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Gm8362-202ENSMUST00000170673 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Rpp30-201ENSMUST00000025714 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Gm45657-201ENSMUST00000211318 1349 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms