Protein–RNA interactions for Protein: Q04207

Rela, Transcription factor p65, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelaQ04207 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RelaQ04207 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RelaQ04207 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RelaQ04207 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RelaQ04207 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RelaQ04207 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RelaQ04207 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RelaQ04207 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RelaQ04207 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RelaQ04207 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RelaQ04207 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RelaQ04207 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RelaQ04207 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms