Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccl7Q03366 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms