Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GscQ02591 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GscQ02591 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GscQ02591 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GscQ02591 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GscQ02591 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GscQ02591 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GscQ02591 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GscQ02591 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GscQ02591 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GscQ02591 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GscQ02591 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GscQ02591 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GscQ02591 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GscQ02591 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GscQ02591 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GscQ02591 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GscQ02591 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GscQ02591 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GscQ02591 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GscQ02591 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GscQ02591 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GscQ02591 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GscQ02591 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GscQ02591 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GscQ02591 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GscQ02591 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GscQ02591 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GscQ02591 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GscQ02591 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GscQ02591 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GscQ02591 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GscQ02591 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GscQ02591 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GscQ02591 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GscQ02591 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GscQ02591 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GscQ02591 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GscQ02591 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GscQ02591 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GscQ02591 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GscQ02591 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GscQ02591 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GscQ02591 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GscQ02591 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GscQ02591 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GscQ02591 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GscQ02591 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GscQ02591 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GscQ02591 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GscQ02591 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GscQ02591 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GscQ02591 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GscQ02591 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GscQ02591 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GscQ02591 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GscQ02591 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GscQ02591 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GscQ02591 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GscQ02591 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GscQ02591 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GscQ02591 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GscQ02591 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GscQ02591 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GscQ02591 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GscQ02591 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GscQ02591 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GscQ02591 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GscQ02591 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GscQ02591 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GscQ02591 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GscQ02591 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GscQ02591 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GscQ02591 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GscQ02591 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GscQ02591 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GscQ02591 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GscQ02591 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GscQ02591 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GscQ02591 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GscQ02591 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GscQ02591 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GscQ02591 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GscQ02591 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GscQ02591 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GscQ02591 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GscQ02591 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GscQ02591 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GscQ02591 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GscQ02591 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GscQ02591 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GscQ02591 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GscQ02591 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GscQ02591 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GscQ02591 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GscQ02591 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GscQ02591 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GscQ02591 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GscQ02591 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GscQ02591 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms