Protein–RNA interactions for Protein: Q02248

Ctnnb1, Catenin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnb1Q02248 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctnnb1Q02248 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctnnb1Q02248 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctnnb1Q02248 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnnb1Q02248 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnnb1Q02248 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnnb1Q02248 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnnb1Q02248 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnnb1Q02248 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnnb1Q02248 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnnb1Q02248 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnnb1Q02248 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnnb1Q02248 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnnb1Q02248 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnnb1Q02248 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnnb1Q02248 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnnb1Q02248 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnnb1Q02248 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnnb1Q02248 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnnb1Q02248 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnnb1Q02248 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnnb1Q02248 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnnb1Q02248 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnnb1Q02248 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnnb1Q02248 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnnb1Q02248 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnnb1Q02248 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnnb1Q02248 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnnb1Q02248 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnnb1Q02248 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnnb1Q02248 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnnb1Q02248 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnnb1Q02248 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnnb1Q02248 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnnb1Q02248 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnnb1Q02248 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnnb1Q02248 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnnb1Q02248 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnnb1Q02248 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnnb1Q02248 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnnb1Q02248 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnnb1Q02248 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnnb1Q02248 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnnb1Q02248 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnnb1Q02248 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnnb1Q02248 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnnb1Q02248 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnnb1Q02248 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnnb1Q02248 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnnb1Q02248 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnnb1Q02248 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnnb1Q02248 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnnb1Q02248 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnnb1Q02248 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnnb1Q02248 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnnb1Q02248 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnnb1Q02248 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnnb1Q02248 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnnb1Q02248 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnnb1Q02248 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnnb1Q02248 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnnb1Q02248 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnnb1Q02248 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnnb1Q02248 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnnb1Q02248 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnnb1Q02248 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnnb1Q02248 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnnb1Q02248 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnnb1Q02248 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnnb1Q02248 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnnb1Q02248 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnnb1Q02248 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnnb1Q02248 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnnb1Q02248 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnnb1Q02248 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnnb1Q02248 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnnb1Q02248 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnnb1Q02248 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnnb1Q02248 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnnb1Q02248 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnnb1Q02248 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnnb1Q02248 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnnb1Q02248 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnnb1Q02248 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnnb1Q02248 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnnb1Q02248 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnnb1Q02248 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnnb1Q02248 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnnb1Q02248 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnnb1Q02248 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnnb1Q02248 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnnb1Q02248 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnnb1Q02248 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnnb1Q02248 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnnb1Q02248 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnnb1Q02248 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnnb1Q02248 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnnb1Q02248 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnnb1Q02248 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnnb1Q02248 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.9 ms