Protein–RNA interactions for Protein: Q02242

Pdcd1, Programmed cell death protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd1Q02242 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdcd1Q02242 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Pdcd1Q02242 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pdcd1Q02242 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms