Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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PrkcqQ02111 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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PrkcqQ02111 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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PrkcqQ02111 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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PrkcqQ02111 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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PrkcqQ02111 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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PrkcqQ02111 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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