Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HmgcrQ01237 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms