Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Grin2cQ01098 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms