Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms