Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms