Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms