Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms