Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smarcc1P97496 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smarcc1P97496 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smarcc1P97496 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smarcc1P97496 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smarcc1P97496 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms