Protein–RNA interactions for Protein: P97460

Npas2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas2P97460 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Npas2P97460 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Npas2P97460 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Npas2P97460 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Npas2P97460 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Npas2P97460 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Npas2P97460 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Npas2P97460 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Npas2P97460 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Npas2P97460 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Npas2P97460 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Npas2P97460 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Npas2P97460 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Npas2P97460 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Npas2P97460 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Npas2P97460 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Npas2P97460 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Npas2P97460 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Npas2P97460 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Npas2P97460 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Npas2P97460 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Npas2P97460 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Npas2P97460 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Npas2P97460 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Npas2P97460 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Npas2P97460 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Npas2P97460 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Npas2P97460 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Npas2P97460 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Npas2P97460 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Npas2P97460 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Npas2P97460 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Npas2P97460 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Npas2P97460 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Npas2P97460 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Npas2P97460 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Npas2P97460 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Npas2P97460 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Npas2P97460 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Npas2P97460 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Npas2P97460 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Npas2P97460 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Npas2P97460 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Npas2P97460 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Npas2P97460 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Npas2P97460 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Npas2P97460 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Npas2P97460 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Npas2P97460 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Npas2P97460 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Npas2P97460 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Npas2P97460 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Npas2P97460 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Npas2P97460 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Npas2P97460 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Npas2P97460 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Npas2P97460 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Npas2P97460 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Npas2P97460 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Npas2P97460 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Npas2P97460 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Npas2P97460 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Npas2P97460 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Npas2P97460 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Npas2P97460 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Npas2P97460 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Npas2P97460 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Npas2P97460 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Npas2P97460 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Npas2P97460 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Npas2P97460 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Npas2P97460 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Npas2P97460 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Npas2P97460 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Npas2P97460 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Npas2P97460 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Npas2P97460 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Npas2P97460 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Npas2P97460 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Npas2P97460 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Npas2P97460 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Npas2P97460 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Npas2P97460 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Npas2P97460 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Npas2P97460 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Npas2P97460 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Npas2P97460 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Npas2P97460 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Npas2P97460 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Npas2P97460 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Npas2P97460 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Npas2P97460 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Npas2P97460 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Npas2P97460 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Npas2P97460 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Npas2P97460 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Npas2P97460 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Npas2P97460 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Npas2P97460 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Npas2P97460 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.9 ms