Protein–RNA interactions for Protein: P97353

Sec1, Galactoside 2-alpha-L-fucosyltransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec1P97353 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec1P97353 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec1P97353 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec1P97353 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec1P97353 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec1P97353 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec1P97353 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec1P97353 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec1P97353 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec1P97353 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec1P97353 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec1P97353 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec1P97353 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec1P97353 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec1P97353 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec1P97353 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec1P97353 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec1P97353 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec1P97353 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec1P97353 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec1P97353 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec1P97353 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec1P97353 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec1P97353 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec1P97353 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec1P97353 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec1P97353 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec1P97353 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec1P97353 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec1P97353 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec1P97353 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec1P97353 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec1P97353 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec1P97353 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec1P97353 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec1P97353 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec1P97353 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec1P97353 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec1P97353 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec1P97353 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec1P97353 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec1P97353 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec1P97353 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec1P97353 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec1P97353 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec1P97353 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec1P97353 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec1P97353 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec1P97353 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec1P97353 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec1P97353 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec1P97353 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec1P97353 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec1P97353 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec1P97353 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec1P97353 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec1P97353 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec1P97353 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec1P97353 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec1P97353 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec1P97353 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec1P97353 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec1P97353 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec1P97353 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec1P97353 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec1P97353 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec1P97353 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec1P97353 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec1P97353 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec1P97353 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec1P97353 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec1P97353 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec1P97353 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec1P97353 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec1P97353 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec1P97353 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec1P97353 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec1P97353 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec1P97353 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec1P97353 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec1P97353 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec1P97353 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec1P97353 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec1P97353 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec1P97353 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec1P97353 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec1P97353 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec1P97353 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec1P97353 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec1P97353 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec1P97353 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec1P97353 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec1P97353 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec1P97353 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec1P97353 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec1P97353 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec1P97353 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec1P97353 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec1P97353 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec1P97353 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms