Protein–RNA interactions for Protein: P97348

Rhod, Rho-related GTP-binding protein RhoD, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhodP97348 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RhodP97348 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RhodP97348 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RhodP97348 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RhodP97348 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RhodP97348 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RhodP97348 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RhodP97348 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RhodP97348 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RhodP97348 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RhodP97348 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RhodP97348 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RhodP97348 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RhodP97348 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RhodP97348 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RhodP97348 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RhodP97348 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RhodP97348 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RhodP97348 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RhodP97348 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RhodP97348 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RhodP97348 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RhodP97348 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
RhodP97348 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RhodP97348 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
RhodP97348 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
RhodP97348 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RhodP97348 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
RhodP97348 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RhodP97348 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RhodP97348 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RhodP97348 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RhodP97348 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RhodP97348 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RhodP97348 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RhodP97348 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RhodP97348 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RhodP97348 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RhodP97348 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RhodP97348 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RhodP97348 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RhodP97348 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RhodP97348 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RhodP97348 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RhodP97348 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
RhodP97348 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
RhodP97348 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
RhodP97348 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
RhodP97348 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
RhodP97348 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
RhodP97348 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
RhodP97348 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
RhodP97348 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RhodP97348 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RhodP97348 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RhodP97348 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RhodP97348 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RhodP97348 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RhodP97348 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RhodP97348 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RhodP97348 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RhodP97348 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
RhodP97348 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RhodP97348 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RhodP97348 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RhodP97348 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RhodP97348 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RhodP97348 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RhodP97348 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RhodP97348 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RhodP97348 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RhodP97348 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RhodP97348 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RhodP97348 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RhodP97348 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RhodP97348 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RhodP97348 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RhodP97348 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RhodP97348 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RhodP97348 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RhodP97348 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RhodP97348 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RhodP97348 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RhodP97348 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RhodP97348 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RhodP97348 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RhodP97348 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RhodP97348 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RhodP97348 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RhodP97348 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RhodP97348 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
RhodP97348 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RhodP97348 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
RhodP97348 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RhodP97348 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RhodP97348 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RhodP97348 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RhodP97348 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RhodP97348 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
RhodP97348 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms