Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Vgll3P85442 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms