Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arf1P84078 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arf1P84078 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Arf1P84078 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arf1P84078 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Arf1P84078 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms