Protein–RNA interactions for Protein: P82347

Sgcd, Delta-sarcoglycan, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcdP82347 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgcdP82347 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgcdP82347 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SgcdP82347 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SgcdP82347 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SgcdP82347 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SgcdP82347 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SgcdP82347 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
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