Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Otx1P80205 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Otx1P80205 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Otx1P80205 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Otx1P80205 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Otx1P80205 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Otx1P80205 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Otx1P80205 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Otx1P80205 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Otx1P80205 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Otx1P80205 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Otx1P80205 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Otx1P80205 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms