Protein–RNA interactions for Protein: P70671

Irf3, Interferon regulatory factor 3, mousemouse

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Length 419 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf3P70671 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irf3P70671 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irf3P70671 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Irf3P70671 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irf3P70671 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Irf3P70671 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irf3P70671 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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