Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Tp53bp1P70399 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms