Protein–RNA interactions for Protein: P70279

Surf6, Surfeit locus protein 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf6P70279 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Surf6P70279 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Surf6P70279 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Surf6P70279 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Surf6P70279 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Surf6P70279 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Surf6P70279 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Surf6P70279 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Surf6P70279 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Surf6P70279 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Surf6P70279 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms