Protein–RNA interactions for Protein: P70255

Nfic, Nuclear factor 1 C-type, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NficP70255 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NficP70255 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NficP70255 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NficP70255 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NficP70255 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NficP70255 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NficP70255 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NficP70255 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NficP70255 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NficP70255 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NficP70255 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NficP70255 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NficP70255 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NficP70255 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NficP70255 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NficP70255 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NficP70255 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NficP70255 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NficP70255 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NficP70255 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NficP70255 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NficP70255 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NficP70255 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NficP70255 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NficP70255 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NficP70255 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NficP70255 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NficP70255 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NficP70255 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NficP70255 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NficP70255 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NficP70255 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NficP70255 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NficP70255 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NficP70255 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NficP70255 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NficP70255 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NficP70255 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NficP70255 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NficP70255 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NficP70255 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NficP70255 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NficP70255 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NficP70255 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NficP70255 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NficP70255 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NficP70255 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NficP70255 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NficP70255 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NficP70255 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NficP70255 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NficP70255 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NficP70255 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NficP70255 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NficP70255 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NficP70255 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NficP70255 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NficP70255 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NficP70255 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NficP70255 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NficP70255 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NficP70255 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NficP70255 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NficP70255 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NficP70255 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NficP70255 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NficP70255 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NficP70255 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NficP70255 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NficP70255 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NficP70255 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NficP70255 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NficP70255 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NficP70255 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NficP70255 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NficP70255 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
NficP70255 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NficP70255 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NficP70255 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NficP70255 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NficP70255 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NficP70255 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NficP70255 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NficP70255 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NficP70255 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NficP70255 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NficP70255 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NficP70255 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NficP70255 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NficP70255 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NficP70255 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NficP70255 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NficP70255 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NficP70255 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NficP70255 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NficP70255 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NficP70255 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NficP70255 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NficP70255 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NficP70255 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms