Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chl1P70232 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chl1P70232 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chl1P70232 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chl1P70232 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chl1P70232 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chl1P70232 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chl1P70232 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chl1P70232 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Chl1P70232 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chl1P70232 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chl1P70232 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chl1P70232 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chl1P70232 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chl1P70232 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chl1P70232 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Chl1P70232 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Chl1P70232 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chl1P70232 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chl1P70232 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chl1P70232 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Chl1P70232 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chl1P70232 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chl1P70232 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chl1P70232 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chl1P70232 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chl1P70232 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chl1P70232 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chl1P70232 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chl1P70232 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chl1P70232 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chl1P70232 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chl1P70232 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chl1P70232 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chl1P70232 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Chl1P70232 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chl1P70232 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chl1P70232 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chl1P70232 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chl1P70232 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chl1P70232 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chl1P70232 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chl1P70232 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chl1P70232 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chl1P70232 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chl1P70232 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chl1P70232 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Chl1P70232 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chl1P70232 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chl1P70232 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Chl1P70232 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chl1P70232 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chl1P70232 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Chl1P70232 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chl1P70232 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chl1P70232 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chl1P70232 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chl1P70232 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chl1P70232 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chl1P70232 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chl1P70232 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chl1P70232 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chl1P70232 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chl1P70232 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chl1P70232 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chl1P70232 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chl1P70232 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chl1P70232 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chl1P70232 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Chl1P70232 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Chl1P70232 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chl1P70232 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chl1P70232 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chl1P70232 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chl1P70232 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chl1P70232 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chl1P70232 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chl1P70232 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chl1P70232 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chl1P70232 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chl1P70232 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chl1P70232 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chl1P70232 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chl1P70232 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chl1P70232 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chl1P70232 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chl1P70232 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chl1P70232 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Chl1P70232 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Chl1P70232 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Chl1P70232 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Chl1P70232 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chl1P70232 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chl1P70232 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chl1P70232 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chl1P70232 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chl1P70232 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chl1P70232 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chl1P70232 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chl1P70232 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms