Protein–RNA interactions for Protein: P70195

Psmb7, Proteasome subunit beta type-7, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb7P70195 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmb7P70195 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmb7P70195 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmb7P70195 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmb7P70195 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmb7P70195 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmb7P70195 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmb7P70195 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmb7P70195 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb7P70195 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb7P70195 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb7P70195 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb7P70195 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb7P70195 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb7P70195 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb7P70195 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb7P70195 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb7P70195 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb7P70195 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb7P70195 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb7P70195 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb7P70195 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb7P70195 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb7P70195 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb7P70195 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb7P70195 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb7P70195 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb7P70195 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb7P70195 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb7P70195 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb7P70195 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb7P70195 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb7P70195 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb7P70195 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb7P70195 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb7P70195 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb7P70195 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb7P70195 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmb7P70195 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmb7P70195 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmb7P70195 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmb7P70195 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmb7P70195 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmb7P70195 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmb7P70195 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmb7P70195 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmb7P70195 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmb7P70195 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmb7P70195 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmb7P70195 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmb7P70195 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmb7P70195 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmb7P70195 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmb7P70195 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmb7P70195 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmb7P70195 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmb7P70195 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmb7P70195 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmb7P70195 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmb7P70195 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmb7P70195 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmb7P70195 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmb7P70195 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb7P70195 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb7P70195 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb7P70195 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb7P70195 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb7P70195 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb7P70195 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb7P70195 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb7P70195 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb7P70195 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb7P70195 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb7P70195 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb7P70195 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb7P70195 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb7P70195 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb7P70195 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb7P70195 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb7P70195 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb7P70195 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb7P70195 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb7P70195 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb7P70195 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb7P70195 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb7P70195 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb7P70195 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb7P70195 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb7P70195 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmb7P70195 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmb7P70195 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmb7P70195 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmb7P70195 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmb7P70195 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmb7P70195 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmb7P70195 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmb7P70195 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmb7P70195 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmb7P70195 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmb7P70195 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms